電影: Wakana Yamazaki

柯南與少年偵探團受邀來到八丈島海域賞鯨，卻意外捲入黑暗組織的陰謀事件。柯南收到赤井秀一的消息，得知有一位歐洲刑警機構職員遭到琴酒殺害，於是決定潛入海洋設施「太平洋浮標」進行調查，然而在調查過程中，灰原哀的生命卻陷入險境。柯南能否順利救出灰原？灰原的真實身分是否會被發現？新的黑影PINGA又是誰？...

怪盜基德對斧江財團位於北海道函館的收藏庫發出了預告信，然而奇怪的是，向來只愛盜取名貴珠寶的基德，這次鎖定的目標竟然是一把幕末時代的日本刀。在此同時，柯南與關西名偵探服部平次，正巧為了劍道大會也來到了函館，面對神秘的殺人事件以及基德的公然挑戰，柯南與平次能否成功阻止基德？而秘藏在刀裡的驚人真相又究竟為何？...

兩年前，10歲的天才少年澤田弘樹在完成人工智慧後墜樓身亡。兩年後的某一天，眾多政商名流來到米花市政大樓。這裡正在舉行能夠一舉改變全世界遊戲業界價值觀的模擬遊戲機「繭」的發表會。他們的子女全都受邀參加。玩家可透過這個遊戲，進入虛擬世界中，體驗實地遊玩遊戲的快感。結合最先進技術的「繭」，其遊戲方式是先進入一部外型酷似蠶繭的大型膠囊，透過電腦操作讓遊戲者沉睡於歷史上曾經發生過事件的年代，並進行挑戰的虛擬體驗遊戲。 柯南、灰原及少年偵探團成員們也接獲邀請，前往參加這場受到全世界矚目的發表會，並陰錯陽差...

時間是「大海賊時代」，某天得知故鄉「東海」發生危機的草帽海賊團，打算暫時中斷冒險返回東海，此時他們看到空中出現一艘莫名的海賊船，由於娜美預測到眼前即將出現暴風雨，並利用從那艘船上丟下來的「音貝」作通知，暴風雨過後海賊船的主人「金獅子」獅鬼來到千陽號上，表示要運用他的「飄飄果實」能力載魯夫等人回到東海當作謝禮，令魯夫等人相當興奮，誰知途中獅鬼卻突然解除了千陽號的浮力，並趁機擄走娜美，原來獅鬼看上了娜美能用身體感知氣候的能力，想讓她成為自己海賊團的航海士，魯夫等人則跟著千陽號一起從上空墜落到浮遊島「...

小五郎應京都寺院的邀請，前往京都調查寺內八年前佛像盜竊事件。寺院早前得到佛像下落的線索，是一件有不同圖案的圖畫，提供給小五郎，以便儘快尋回佛像。同時間，東京、大阪和京都發生殺人事件，三個城市的警方調查後，發現事件中的死者都是盜賊團「源氏螢」的成員，毎人都有一個代名，以《義經》內的傳統人物命名。服部亦因此事，前往京都調查殺人事件的真相。期間遇上柯南，兩人一起調查兩宗事件，發現兩宗事件都有共同點，有助解開八年前佛像盜竊事件。在調查期間亦發生殺人案，服部因此而受襲，和葉亦因查找施襲者線索而被人挾持。...

6件大範圍的連續殺人事件發生在東京周邊的數個地區。目暮警官以及曾在動畫版出現過的其他警察集合召開搜查會議，小五郎也以特別顧問的身份被邀請前去參加。此時柯南卻因為一個偶然的契機，發現一個警察從會議中離席，並乘上了保時捷356A-琴酒的車離去！！「黑暗組織」的一員居然潛入了搜查會議，連續殺人事件莫非是「黑暗組織」做下的邪惡勾當？事態一觸即發！！如果讓琴酒知道工藤新一仍然活著，那麼不只新一本人、只要是認識他的所有人也都會被組織極力剷除。所以在明知危機四伏的情況下，柯南仍然開始單獨進行調查，慢慢發現有關...

怪盜基德再度發出預告信，目標是俄羅斯羅曼諾夫王朝的皇室秘寶「回憶之卵」。柯南與服部聯合保護「回憶之卵」，但把作案時間推理錯誤令基德得逞，但基德於逃走中途被狙擊。自此引出一連串疑問，柯南將解開一連串事件。...

柯南用新一的身份在電話不自願地約會了小蘭，陪她看5月3日的午夜場電影，以便請求小蘭替他參加森谷帝二教授舉辦的茶會。柯南為此十分煩惱，不知如何掩飾他變小的事實。目送小蘭離開後，柯南接到一個電話，是來歷不明的炸彈客挑戰柯南！少年偵探團收到的引爆遙控飛機、被安裝了炸彈並裝著小貓的寵物籃，還有東都環狀線的五顆炸彈陷阱，大家奮力推理，才及時預防了可能發生的意外。可是，最後被安裝了炸彈的地點其實是工藤新一和小蘭的約會地點－米花市政大樓！柯南該怎麼辦呢？...

以635米的高度為傲、可以俯瞰東京街景的鈴木塔（Bell Tree Tower）竣工。前往參加其開幕儀式的柯南等人，從眺望台上享受著絕美的景色。就在此時，一發子彈擊碎了窗戶玻璃，打穿了一個男人的胸膛。案件發生於一瞬之間，完全搞不清到底發生了什麼，小蘭與少年偵探團陷入恐慌。柯南立刻利用追蹤眼鏡的望遠鏡功能，沿著彈道發現了一個黑色的身影。「從那麼遠的距離進行狙擊，怎麼可能？！」柯南馬上與女高中生偵探世良真純乘坐摩托車追趕逃走的狙擊手，意想不到的是狙擊手居然連警察的巡邏車都打算一起炸掉，整個追蹤過程都...

柯南和少年偵探團在參觀一座西多摩市新建的雙塔摩天大樓時，意外的發現了黑暗組織成員琴酒（Gin）。隨後又發生了殺人事件。殺人事件還在繼續，共同點是每名死者身邊都會留下一個小的酒杯。就在柯南和少年偵探團尋找兇手的時候，琴酒也得知他正在尋找的叛徒雪莉將在不久之後參加西多摩雙子大樓的落成典禮，並準備在典禮上將她刺殺。在典禮會場上，短暫的黑暗之後又有一人被害。現場也留下了小酒杯，顯示兇手和之前的為同一人。就在警方和毛利小五郎調查案件的時候，琴酒引爆了藏在大樓內的炸藥，銷毀了組織的情報，同時將樓頂的柯南一行...

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一個月黑風高的晚上，某個間諜趁隙滲透日本警方，欲竊取各國情報局的機密檔案，包括英國 MI6、德國 BDN、美國 CIA，甚至還有 FBI 等各國諜報機構。幸好安室透(波本)領導的日本公安局及時趕到，間諜想利用偷來的車逃脫，於高速公路上展開激烈追逐戰，其他的車輛也被捲入，千鈞一發之際，卻被FBI探員赤井秀一的來福槍擊中，從公路墜下懸崖。 隔天，柯南一行人前往東京的一間水族館，意外發現一名受傷的女子。她的雙眼有著不同的顏色，仔細一看她的兩隻眼睛的瞳孔顏色不一樣，也就是俗稱的“陰陽眼” ，且失去了記憶...

一名神秘少年突然出現在小兔等人面前。並向地場衛說要遵受兒時的承諾，帶阿衛到花之行星去。於是小兔等人到行星，阿衛這時才記得那少年承諾會為他帶來一朵漂亮的花給他，而這朵花就是控制著少年菲歐雷的邪惡之花。為了侵略地球，邪惡之花開始襲擊大家，大家決心展開地球保衛戰。水準極高。...

梵谷名畫《向日葵》被發現，並將在紐約拍賣，然而在《向日葵》的發現地卻發生了殺人事件。在紐約拍賣會現場，全世界的大富豪匯集一堂，競拍《向日葵》。鈴木次郎吉以遠高於他人出價的3億美金將此畫拍下，他的目的是集齊散落在世界各地的7幅《向日葵》，以此能在日本舉辦史無前例的大規模展會。這則夢幻大新聞向全世界播出，柯南與灰原也津津有味的看著轉播。當正要徵集專門保護《向日葵》的護衛隊「七大武士」的時候，怪盜基德突然出現，留下了「一定會將此畫奪走」的宣戰預告。明明只偷大型寶石的基德為什麼會對名畫下手？就在此時，在...

世界最大的體育盛會「WSG -World Sports Games-」暌違多年將在東京舉辦。日本為盛大舉行開幕儀式，展現日本最尖端技術──世界首創最高時速1000km的「真空超電導新幹線」，在新名古屋站和東京之間開通！在世人目光的注視下，知名大會贊助商匯集的會場中，各大企業老闆光天化日下相繼被綁架。此時，卻發現赤井秀一竟在背地監視，並指揮FBI成員們的行動。同時，柯南想起15年前在美國波士頓發生的驚悚WSG連續綁架事件也是由FBI負責偵查，或許這一場事件，敵人就是自己人，然而各種證據顯示出的不在...

專針對警察的連續殺人案件發生了，警察內部引起巨大的回響。對於想得到案件情報的小五郎，目暮警部卻意外地守口如瓶。看到如此情況的柯南，聯想到事情可能和警察內部有莫大的關係。然後，下一個被槍擊的目標居然是佐藤刑警，剛巧在案發現場出現的小蘭受到案件的刺激而被弄至失憶。犯人為了殺人滅口，於是企圖把唯一的目擊證人殺害。深知情況嚴重的柯南，為了保護小蘭，不惜孤身犯險去把犯人找出來。...

朝倉市長收到一封神秘的恐嚇信，內容為：「對於你那4年執政中桀驁不馴的態度，上天將給予懲罰！」。隔天，由市長主導開通的新地下鐵隧道遭到炸毀。雖然多虧柯南知道恐嚇信而使得這次爆破事件沒有人員傷亡，但是奪取市長性命失敗的犯人勢必將再次犯案，並帶來更大的災害，調查朝倉市長歷年事政的柯南，察覺到極有可能是在國土交通大臣時代所推動的水庫建設案中，懷有恨意的犯人就在那相關關係人等之中，因此決定進行深度搜查。 因為水庫的建造，沉入湖底的新潟縣北之澤村村民遷移到鄰近土地已有5年了，在這5周年紀念的日子裡聚集了許...

某一天，毛利偵探事務所接到了知名舞台劇女演員牧樹里的委託。委託內容是關於怪盜基德的預告信，信中指出怪盜基德將在舞台上奪取牧樹里佩帶的藍寶石戒指——「命運的寶石」。在劇場裡錯綜複雜的人群中，怪盜基德到底會假扮成誰出現在大家面前？不過，「命運的寶石」終究是保護住了，牧樹里為了表示感謝，邀請毛利偵探前往北海道函館的別墅度假。就在大家都搭上飛機前往函館的機艙裡，一幕精心設計的殺人劇碼就在大家面前實際上演了。江戶川柯南除了要防止怪盜基德再度混入人群中，又要解開發生在飛機上的密室殺人事件，到底江戶川柯南要怎...

柯南、小蘭、毛利小五郎以及少年偵探團等人，一同參加了神盾艦的體驗航海活動，在日本海上自衛隊員的示範下，親眼見識到氣勢非凡的空中對戰演習。這時候，神祕的敵軍突然來襲，演習旋即變成了真實的激烈對戰!小蘭與少年偵探團成員看到眼前的這一切，感到十分恐懼與不安。在海上自衛隊冷靜的應對處理下，戰況總算平息了下來，但是卻摸不清敵人的目的為何。在此同時，艦裏發現了一隻自衛隊員的左手殘肢，那隻手上戴了一隻時間停滯在上午5時30分的手錶……在如此不尋常的事態下，大阪府警方與京都府警方也緊急出動直升機前來現場，協力展...

故事講述柯南他們前往位於太平洋中的美麗小島「神海島」渡假。這座島嶼自古流傳著一則有關於沉沒在海底的古代遺跡「海底宮殿」，以及300年前實際存在的女海盜「安妮·邦尼」、「瑪麗·瑞德」所遺留下來的寶藏傳說。...